本縣已設立身心障礙鑑定門診之醫院有: 1、衛生福利部南投醫院 2、衛生福利部草屯療養院 3、臺中榮民總醫院埔里分院 4、埔基醫療財團法人埔里基督教醫院 5、竹山秀傳醫院 6、佑民社團法人佑民醫院 7、曾漢棋綜合醫院 8、南基醫院 9、東華醫院 10、惠和醫院