為鼓勵國人早期進行檢驗愛滋病毒，本縣積極辦理孕婦、性病患者、藥癮者檢驗、全民檢驗、匿名檢驗之計畫，因此，檢驗科配合本縣計畫，進行愛滋病及梅毒之血清檢驗。

1. 梅毒的檢驗通常分為兩種，本局與本縣衛生所配合，由衛生所進行第一次RPR (Rapid Plasma Reagin) 凝集法篩檢。RPR是檢測梅毒活性的一種「非特異性」檢查，其他非梅毒的狀況（如其他急慢性感染症、風濕及自體免疫疾病、孕婦、老年人以及藥物的干擾）也可能會出現偽陽性反應，故，若衛生所操作RPR凝集試驗呈現陽性，則送由本局進行TPPA梅毒確認試驗，若後者也為有反應且效價高，則表示應為梅毒感染。

2. 愛滋病血清檢驗，本局以ELISA做為第一次篩檢，若呈陽性反應，再重複操作一次ELISA。若仍然呈現陽性反應時，則將血清檢體送至疾病管制署作最後確認方式。